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Literaturrecherche

Auf dieser Seite sind wichtige Links zu wissenschaftlichen Suchmaschinen und bioinformatischen Seiten aufgelistet.

Wissenschaftliche Suchmaschinen

Scirus

ISI - Web of knowledge

SCOPUS

Google Books

NCBI Books

Elektronische Zeitschriftenbibliothek der TIB

Reaxys

Science Huβ

Bioinformatik

Pub Med
Medizinische und Molekularbiologische Suchmaschine

KEGG

Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes - genetische Datenbank v.a. für Stoffwechselwege und Metaboliten

NAR

Nucleic Acid Research. Gibt jedes Jahr einen umfassenden Überblick zu biologischen Datenbanken heraus.

NCBI

Pubmed, Protein- und DNA Sequenz-Suche, Taxonomy und Bücher

NCBI-BLAST

Zur Identifizierung von Sequenzen mit dem BLAST Algorithmus

EBI

Das europäische Pendant zu NCBI

Fasta bei EBI

DNA-Bank of Japan

Das japanische Pendant zu EBI, stark auf DNA fokussiert

GenomeNet

Genome Datenbank

Softberry

Alles zum Thema Proteine

Expasy

Proteinstrukturen

Pfam

Sammlung von Proteinfamilien, dargestellt durch Multiple Sequenz Alignments Hidden Markov Modelle

SCOP

Klassifiziert Proteine

TIGR

Alles zum Thema Genome

lablife

Vectoren Datenbank

Multiples Sequenz Alignment

LALIGN Server

Paarweises Sequenzalignment

DotPlots

VectorDB

Vektordatenbank

Restriktionsenzyme Doppelverdau

Sequenzanalysetool zum Doppelverdau mit Restriktionenzymen von Fermentas

GCUA

Analysiert Codon Usage einer Sequenz

Expasy - RandSeq

Generator für Zufallssequenzen

DCA

Divide & Conquer Analyse

Proteinmodelling

JigSaw

Erzeugt 3D-Modelle von Proteinen die auf Homologien zu bekannten Strukturen beruhen

SwissModel

Ähnlich wie JigSaw - arbeitet mit anderen Algorithmen

Motivsuche

MEME

Motiv-basierte Sequenzanalyse

Expasy - ScanProsite

Motivesuche in Sequenzen

Enzyme

Rebase

Restriktionsenzym Datenbank

BRENDA

Enzym Datenbank

 

Biologische Chemie

Molekül Darstellungs- und Bearbeitungsprogramme

Chimera

Darstellung- und Bearbeitungsprogramm von Molekülen - sehr gut für Dockprep

Pymol

Darstellungsprogramm von Molekülen

Docking

Autodock

Beliebtestes Tool für molekulares Docking - sowohl eigentliches Dockingprogramm verfügbar als auch Darstellungstools

GOLD

Besonders gut für Docking mit rotierenden und flexiblen Proteinsequenzen

 

Chemische Strukturen

eMolecules

Chemische Struktursuche

ChemBioFinder

Chemische Struktursuche - auch für Biomoleküle

NCBI - PubChem

Chemische Strukturdatenbank

PDB - Protein Data Bank

Strukturdatenbank von Biomakromolekülen

MMDB

Molecular Modelling Database - für Proteinstrukturen

 

Spektrendatenbanken

NIST Chemistry Webbook
Sammlung von Thermodynamischen Daten und IR-Spektren

SDBS
Spektrendatenbank für organische Verbindungen

RRUFF
Ramanspektren und Röntgendiffraktogramme von Mineralen

Letzte Änderung: 12.03.2017 17:11 von Helmi